Modul de joc constă din puzzle-urile normale de găsire a obiectelor ascunse, dar sunt unele detalii pe care trebuie să le știi înainte de a juca. Mai întâi, pentru a îndepărta obiectele dintr-o listă trebuie să dai click pe ele la locul în care se află. Trebuie să cauți și obiecte unice care sunt înconjurate de altele similare, precum căutarea unui cocktail într-un bar. Dacă dai mai multe click-uri greșite, mous-ul începe să se învârtă într-un cerc pentru puțin timp. Este puțin enervant la început, dar te obișnuești cu acest lucru și joci mai departe.

Jocul Department 42: The Mystery of the Nine are și mini-jocuri interesante, precum puzzle de tip jigsaw, potrivire a trei elemente sau găsirea diferenței. Majoritatea acestor obiecte nu au legătură cu povestea jocului, la fel ca și obiectele ascunse.

Probabil chiar acum vă gândiți că acest joc nu merită jucat, dar greșiți! Jocul are o grafică fantastică și o muzică ambiantă bună. Chiar vă pasă de o poveste complicată? Nu credem, deoarece este doar despre găsirea obiectelor ascunse! Este un joc care trebuie jucat pentru fanii genului!